Во всей необъятной Сибири нет здания более почтенного возраста, чем Софийско-Успенский собор. Он был построен в 1686 году московскими и великоустюжскими мастерами под руководством Г. Шарыпина, Г. Тютина, В. Харитонова и С. Ларионова. В качестве образца была использована Вознесенская церковь Чудова монастыря, расположенного вблизи московского кремля. В 1704 г. к северной стороне собора был пристроен небольшой придел во имя Антония и Феодосия Печерских. В середине XIX в. его переделали и продлили вдоль всей северной стены, освятив во имя Иоанна Златоуста. В крипте придела находятся могилы тобольских митрополитов.

На протяжении нескольких веков Софийско-Успенский собор являлся кафедральным для Тобольской епархии.

В Софийском соборе находятся главные святыни Тобольско-Тюменской митрополии: мощи святителя Иоанна (Максимовича), Митрополита Тобольского и всея Сибири Чудотворца (+1715 г.); мощи священномученика Гермогена (Долганева), епископа Тобольского (+1918 г.); иконы Божией Матери: список с чудотворной Абалакской и Тобольская чудотворная икона Богоматери, а также уникальные для Сибири фрески XVIII века.